Dalam rangka mewujudkan visi tersebut, Badan Pendapatan Daerah Kabupaten Jombang menetapkan misi sebagai berikut:

• Membangun dan Mengembangkan Badan Pendapatan Daerah menjadi Institusi yang professional.

• Meningkatkan partisipasi dan kepatuhan masyarakat serta dunia usaha dalam optimalisasi Pendapatan Asli Daerah.

• Optimalisasi penerimaan Pendapatan Daerah sebagai sumber pembiayaan penyelenggaraan pemerintahan, pembangunan dan kemasyarakatan.

• Meningkatkan kualitas pelayanan, system data dan informasi serta manajemen Pendapatan Daerah.